成立伊始，上海市水利院就致力于探索治水之道，对河湖水系及水环境治理孜孜以求，与上海水务行业各界一齐发力，完成了上海史上最大规模的骨干河道整治，承担了苏州河环境综合整治工程、长三角一体化示范区元荡和淀山湖堤防达标及岸线生态修复工程、青浦环城水系治理工程及中国共产党诞生地之一嘉兴南湖水环境提升等工程，开展以平原河网水系及湖泊为特色的松江全国水利风景区、滴水湖全国水利风景区、花博会水系等水景观营造，凸显了江南水清、水秀、水柔，为上海的“天蓝、水清、岸绿”环境治理目标打下了基础，并为全国城市河道环境治理提供了典范。在生态文明建设不断深入的背景下，上海市水利院始终秉承治水初心，不断创新治水理念，积累河湖治理关键技术，探索水利、景观、生态、人文、艺术等多学科之间的融合，设计蓝绿相融、健康永续的美丽河湖，让河湖水系兼具工程和文化艺术美。